1951年 组建“华东军政委员会司法部法医研究所”

1953年 更名为“最高人民法院华东分院法医研究所”

1955年 由司法部主管，更名为“司法部法医研究所”

1955年 经司法部批准，增挂“司法部司法鉴定科学研究所”牌子

1958年 更名为“公安部三局刑事技术研究所”

1960年 因故撤销

1979年 筹备复建“司法部司法鉴定科学技术研究所”

1983年 经国家科委批准正式复建“司法部司法鉴定科学技术研究所”

1984年 经国家科技部批准，上海出版署备案，《法医学杂志》创刊

2000年 经司法部批准，增挂“司法部司法鉴定中心”牌子

2001年 经国家科技部同意，国家出版总署批准，《中国司法鉴定》杂志创刊

2001年 经司法部批准，成立“上海市道路交通事故鉴定中心”

2002年 法医物证与法医毒化专业获上海市计量认证合格证书

2003年 经司法部批准，成为“全国司法鉴定人继续教育基地”

2004年 获国家检查机构认可和实验室认可证书，成为全国首家全面通过国家认可的司法鉴定机构

2005年 经上海市司法局审核登记，成立“司法鉴定科学技术研究所 司法鉴定中心”

2006年 获国家能力验证计划提供者认可证书，取得实施行业能力验证活动的资质

2009年 获国家级实验室/检查机构资质认定、国家实验室认可、检查机构认可、能力验证提供者认可证书

2009年 成为“上海市法医学重点实验室”

2009年 经人社部批准，设立博士后科研工作站

2010年 经五部委遴选，成为“国家级司法鉴定机构”

2012年 经国标委批准，建设“国家级司法鉴定服务业标准化试点”

2012年 牵头承担“十二五”国家科技支撑计划项目

2014年 确定为“上海市司法鉴定专业技术服务平台”

2016年 英文学术期刊Forensic Sciences Research 创刊

2017年 经中央编办批准，更名为2024澳门历史记录查询

2018年 获批国家级服务业标准化示范项目

2019年 环境损害司法鉴定资质通过行政审批

2019年 研究院牵头研制的11项司法鉴定国家标准正式颁布

2020年 荣获2020年度中国标准创新贡献奖组织奖

2022年 成为“司法部司法鉴定重点实验室”